第9回:速くならない?とりあえずライブラリに頼ろう!

前回に引き続き、OpenACCでうまく行かないケースとその解決策について学びます。

​特に計算が複雑になればなるほど、思ったほどの性能が出ないケースが増えてきます。
そんな時はどうしたら良いのでしょうか?

速くならない?とりあえずライブラリに頼ろう!

OpenACCを使ってみたはいいものの、思ったほど計算が速くならない…そういうケースは多々あります。

代表的な例は行列積演算です。行列と行列の積を求める計算(は行列)は、シミュレーションなどでも頻出する計算です。

OpenACCを使えばとても簡単にGPUで実行できます(図1)。

行列サイズを1024×1024として、東大のReedbush-HスパコンのP100 GPUで計測してみましょう。

P100の理論性能は5300 GFlops(1秒間に5.3兆回の倍精度浮動小数点演算が可能)ですが、この行列積の結果は…

図1:OpenACCによる行列積
図1:OpenACCによる行列積

​​305 GFlops!
スペックの十分の一も出てませんね!
この結果については、別にOpenACCが悪いわけではありません。

実は速い行列積プログラムを実装するというのは大変で、CPUでもGPUでもかなりの最適化が必要です。仮にCUDAを使ったとしても、図1と同程度に単純な実装であれば、OpenACCと似たような性能になるでしょう。

ではOpenACCだと何が大変なのか。
それは最適化です。

この行列積を最適化して速くしようと思っても、OpenACCの制約の中ではここからほとんど何もやりようがありません!

これはGPUのshared memoryと呼ばれる高速なメモリをOpenACCから自由に使うことができないためです(一応、cache指示文というものを使えばshared memoryを利用すること自体はできますが、スレッド間の同期がとれないので十全には使えません)。

であればどうすればよいのでしょうか。ライブラリを呼びましょう!

OpenACCからも、CUDA向けに作られたcublasなどのライブラリを利用できるのです!

倍精度の行列-行列積なら、cublasDgemmという関数(図2)が使えます!

図2:cublasDgemm
図2:cublasDgemm(NVIDIA DEVELOPER ZONEより)

cublasDgemmは、(Cはm*n, Aはm*k, Bはk*nの行列)を計算する関数です。
alpha = 1, beta = 0としたら、図1と同じ行列積ができます。

lda, ldb, ldcは、行列の一次元目の長さなので、この場合ならlda = m, ldb = k, ldc = mとなります。
​transaとtransbは、A, Bを転置するかどうかを表す変数で、CUBLAS_OP_Nが転置しない場合、CUBLAS_OP_Tが転置する場合を表します。

Handleはcublas側で利用するもので、使い方は図3を見てください。

図3:OpenACCにおけるcublasDgemm
図3:OpenACCにおけるcublasDgemmの利用例。

図3は、OpenACCでcublasDgemmを使った利用例です。
ソースコードはこのリンクからダウンロードできます。

Cublasの利用方法に従い、handleなどの変数を用意していきますが、ここで一つ困ったことが起きます。

CublasはCUDA向けに作られたBLASライブラリですから、配列A,B,CはGPU上に確保されてなければなりません。
​加えて、cublasDgemmの引数として渡すのは、A,B,CのGPU上のアドレスでなければなりません!

OpenACCのdata指示文を使った場合、data指示文で囲まれた範囲で、CPU用の配列とGPU用の配列のペアが生成されるのでした。

細かい話ですがこの際、配列へのアクセスがdata指示文の内側かつkernels指示文の内側で行われたならGPU用の配列が使われ、data指示文の内側であってもkernels指示文の外側で行われたならCPU用の配列が使われます。
つまり普通にcublasDgemmに配列A,B,Cを渡しても、それはCPU上のアドレスになってしまうのです!

ここで登場するのが、#pragma acc host_data という指示文です。z


この指示文を使うと、kernelsの内側でなくてもGPU上のアドレスを得られます。Host_dataに続いてuse_device(変数名)とすることで、host_dataで囲まれた範囲の中では、指定された変数のGPU側のアドレスを使うことができるのです。

この指示文はライブラリの呼び出しに使える他、CUDAと組み合わせる際にも利用できます!
Host_data指示文を使うことで、無事cublasを使うことができました。

その性能は…3,950 GFlops!
10倍以上速くなりましたね。

今回の行列積のように、計算量オーダーの大きい計算パターンでは、OpenACCで十分な性能が得られないケースが多いです。

計算量とは、データ量nに対して必要な計算回数のことです。
例えば行列サイズが10*10=100の行列の積であれば、浮動小数点演算は、足し算が100*100*(100-1) = 990,000回、掛け算が100*100*100 = 1,000,000回、合わせて大体200万回。これはおおよそ、データ量nに対してn3に比例した回数になるので、O(n3)の計算量オーダーと言います。

計算量オーダーの大きい計算パターンを高速化する上で、必須の最適化が高速なメモリの利用であり、GPUの場合はshared memoryの利用なのです。

つまりOpenACCは、設計段階から計算量オーダーの大きい計算パターンを捨てている、と言っても過言ではありません。

その代わりに、今回のhost_data指示文のように、cublasなどのライブラリやCUDAと連携するための機能を、これまた設計段階から用意していたのです。

このOpenACCの設計思想をくみ取れば、

  1. ひとまず全てOpenACCで並列化
  2. OpenACCでは十分に性能が得られなかった部分を、ライブラリやCUDAに置き換えて高速化

という手順が王道であることがわかります。

無理にOpenACCで完結するのではなく、積極的にライブラリなどを使ってみてください。

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講習会ページ
https://www.cc.u-tokyo.ac.jp/events/lectures/

講習会で用いているプログラム
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